Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ME1P48163 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ME1P48163 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME1P48163 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms