Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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