Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms