Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms