Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XBP1P17861 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms