Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 HAUS1P2-201ENST00000439908 784 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 CCDC144NL-AS1-206ENST00000443508 1216 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 LINC00662-207ENST00000590677 883 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC132216.1-201ENST00000610375 1158 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC109587.1-213ENST00000610844 652 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms