Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GP1BBP13224 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms