Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms