Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms