Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms