Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms