Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DIRC3C9JPN6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms