Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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C9orf172C9J069 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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C9orf172C9J069 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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C9orf172C9J069 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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C9orf172C9J069 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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C9orf172C9J069 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C9orf172C9J069 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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C9orf172C9J069 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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