Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
C9orf170A2RU37 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf170A2RU37 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms