Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms