Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms