Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LHX3Q9UBR4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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