Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT23Q9C075 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms