Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKD2Q9BZL6 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms