Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms