Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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IFT27Q9BW83 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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IFT27Q9BW83 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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