Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms