Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHP1Q99653 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms