Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP89Q96ST8 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms