Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG3Q96JB2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms