Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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