Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms