Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms