Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms