Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SVOPQ8N4V2 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms