Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms