Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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