Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms