Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ADGRF5P2-201ENST00000423199 1659 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CFAP43-204ENST00000369720 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CACNG4-201ENST00000262138 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CYP39A1-205ENST00000619708 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PRAMEF9-201ENST00000415919 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AP1B1-205ENST00000415447 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 FOSB-206ENST00000586615 3774 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 EGFLAM-202ENST00000336740 3071 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 LLPH-202ENST00000446587 1177 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC068987.2-201ENST00000565518 896 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MYL9-201ENST00000279022 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TMEFF2-202ENST00000392314 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MASP1-201ENST00000169293 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 NDST2-207ENST00000639645 2448 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CCDC122-201ENST00000444614 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 OLFML2B-203ENST00000367940 2685 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 EPS15L1-203ENST00000535753 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 RSBN1-206ENST00000616024 2703 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms