Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms