Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms