Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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KRTAP21-1Q3LI58 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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KRTAP21-1Q3LI58 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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