Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms