Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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