Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SYT16Q17RD7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SYT16Q17RD7 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms