Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 EFHC1-201ENST00000371068 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 BOD1L1-201ENST00000040738 10565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 C1orf198-203ENST00000470540 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SPECC1L-204ENST00000437398 6674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ACCS-201ENST00000263776 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CAMTA2-201ENST00000348066 4491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 RYR1-201ENST00000355481 15377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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VAMP3Q15836 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 KLLN-201ENST00000445946 4277 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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VAMP3Q15836 MYO7B-202ENST00000409816 6694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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VAMP3Q15836 AGK-201ENST00000355413 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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VAMP3Q15836 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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VAMP3Q15836 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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VAMP3Q15836 ACACB-201ENST00000338432 9360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SMAP1-203ENST00000370455 3333 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AIF1L-206ENST00000372302 3340 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 XIRP1-202ENST00000396251 6040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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