Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TAF11Q15544 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms