Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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