Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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