Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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