Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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