Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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