Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM28Q13263 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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