Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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DUSP4Q13115 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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