Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms